DNAシーケンス解析 受託解析サービスの案内へ
当センターが開発した「データ管理システム」（下図）は、全国の受託解析を希望するユーザーが、インターネットを介して自分のコンピュータ端末からセンターのサーバにアクセスして、解析を委託するとともに結果を生データで入手し、即データ解析ができる仕組みです。なお、データの機密保持の観点から、ユーザーは登録時に取得するIDとパスワードを使用してアクセスすることとなっており、利便性とセキュリティーを備えたものとして評価されています。
データ管理システムの特長
1. ユーザーからDNA塩基配列決定などの委託を受け、分析を行い、委託先にデータ結果を送付する情報システムです。
2. 受理したサンプルはバーコードおよびデータベースにより管理し、ユーザーは分析の進捗状況を知るこができます。
3. DNA塩基配列データは、DNAシーケンサーから自動的に収集保管され、相同性検索処理の解析を行うことができます。
4. ユーザーは、インターネットを介して大量のデータを高速で相同性検索にかけることができます。
DNA塩基配列の受託解析のご利用について
当センターにおけるDNAの塩基配列の解析は、DNAポリメラーゼの特性を利用した「ジデオキシ法」を用いており、その原理は下図の通りです。
当センターでは、4種類のサンプル（1.大腸菌、2.未精製PCR産物、3.精製済みDNA[例：プラスミド、PCR産物]、4.シーケンス反応済みサンプル）を受け付けており、少数（1サンプル）でも大量解析（1000サンプル以上）でも可能です。また、蓄積されたノウハウで様々な難読テンプレート（例えば、Gateway system (Invitrogen社)のベクター、GCリッチ、PCR産物、Fosmid/Bacクローン）にも対応できます。
サンプル到着後、約1～3日でデータを返送いたします。また、独自に考案したデータ品質を示す数値（QV）を算出しております。
当センターでは、4種類のサンプル（1.大腸菌、2.未精製PCR産物、3.精製済みDNA[例：プラスミド、PCR産物]、4.シーケンス反応済みサンプル）を受け付けており、少数（1サンプル）でも大量解析（1000サンプル以上）でも可能です。また、蓄積されたノウハウで様々な難読テンプレート（例えば、Gateway system (Invitrogen社)のベクター、GCリッチ、PCR産物、Fosmid/Bacクローン）にも対応できます。
サンプル到着後、約1～3日でデータを返送いたします。また、独自に考案したデータ品質を示す数値（QV）を算出しております。
